| Fonction |
Bioinformaticienne, chef de projet
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| Biographie / CV |
A la recherche d’un poste sur le bassin genevois suite à un rapprochement de conjoint.
Je dispose de 9 ans d’expérience en gestion de projet de données biologiques:
- - Traitement des données de types génomique, transcriptomique et métabarcoding.
- - Gestion de projets sur diverses thématiques permettant adaptabilité et réactivité.
Autonomie, travail en équipe, esprit d’initiative et adaptabilité acquis au cours de mes expériences professionnelles.
Rigueur et esprit méthodique inhérents aux métiers des sciences.
Pédagogie, démontrée dans le cadre des formations professionnelles dispensées et enseignements.
Écoute et prise en compte des demandes utilisateurs.
Altruisme, à l’écoute du bien être des collaborateurs, formée à l’évaluation et l’accompagnement des risques psychosociaux (RPS).
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| Activité |
Janvier 2012 à Février 2020 – Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) – Laboratoire d’Ecologie Microbienne, Lyon, France
Ingénieur d’études en analyses de données biologiques
Gestion de projets et mise en place de pipeline pour le traitement et l'analyse des grands jeux de données :
- Analyses de communautés : métabarcoding sur gènes fonctionnels, rrs
- Assemblage de génomes bactériens
- Transcriptomique, Métagénomique et Métatranscriptomique
- Mise en place, intégration et maintien de bases de données MySQL
Accompagnement, conseil et formation des personnels pluridisciplinaires au traitement des données.
Participation à la rédaction d'articles scientifiques, matériels et méthodes.
Activité de terrain lors de projets spécifiques : grotte de Lascaux, Aven Orgnac.
Encadrement technique de stagiaires (de la licence au Master 2) et doctorants.
Coordinatrice Hygiène et Sécurité de l'unité
Assistante de prévention depuis 2013
Coordinatrice du réseau interne depuis 2013 : 6 Assistants de prévention et un correspondant H&S
- Application de la politique de sécurité des tutelles (4) au sein de l'unité multi-sites (5 bâtiments, 3 campus). Interlocutrice privilégiée avec les services SHS des tutelles, CRHSCT
- Rédaction du Document Unique d’Évaluation des Risques
- Diffusion des informations, bonnes pratiques et recommandations des tutelles
- Tenue des registres de sécurité
- Gestion des déchets biologiques et chimiques
- Saisies, accueil et formation des nouveaux entrants à la sécurité
- Déclarations d'accidents du travail
- Demandes d'agréments OGM
Représentante élue au Conseil de Laboratoire (corps ITA Ingénieur - Technicien - Administratif)
Membre du Conseil de Gestion du laboratoire (25 personnes)
Secouriste du travail et Responsable Sécurité Evacuation
Jury de concours CNRS interne et externe
BAP A Sciences du Vivant, de la Terre et de l’Environnement
Membre experte Ingénieure biologiste en traitement de données
Octobre 2015 à Décembre 2015 – Centre National des Arts et Métiers, Lyon, France
Enseignante
Module “utilisation et applications de la bioinformatique” Cours et travaux dirigés – 20H
Avril 2011 à décembre 2011 – Institut National de Recherche Agronomique (INRA), Clermont-Ferrand, France
Assistante Ingénieur en traitement de données
Analyse et annotation du génome du blé T.aestivum
Développement et mise en place d’un pipeline d’annotation de BAC, détection et annotation d’éléments transposables
Autoformation PERL
Mars 2010 à Octobre 2010 – GALDERMA, Sophia Antipolis, France
Stagiaire en analyses de données transcriptomiques
Analyses transcriptomiques de données de puces ADN issues de patients avec atteintes dermatologiques (psoriasis, dermatite atopique, rosacée etc)
Autres expériences
Ouvrier agricole, employé de blanchisserie, employé polyvalent (vente, mise en rayon)
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| Compétences |
Assemblages génomes
Analyses de communautés
Annotation de génomes
Programmation (PERL, Python, R)
BASH
Utilisation cluster de calcul
Banques de référence
Pack Office
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